На ночном отделении престижной академии Кросс учится лучшие студенты и просто красавцы. Мало кто знает, что на самом деле они вампиры. Юки и Зеро, дети ректора академии и ученики дневного отделения, - стражи школы, их задача следить, чтобы тайна осталась тайной.
Юки изо дня в день выполняет свою работу, но ее прошлое тоже полно секретов, она помнит себя лишь с тех пор, как ей исполнилось пять лет. Прошлое Зеро, который всей душой ненавидит вампиров, скрывает еще более страшную тайну... Прямое продолжение первого сезона. Зеро возвращается после его исчезновения из Академии. Несмотря на испытываемое ею облегчение, Юки (чьё прошлое по-прежнему покрыто тайной), гадает, что же именно случилось с Зеро после того, как они разлучились. Зеро, сохранив странные видения, появившееся в тот день, когда он испил крови Канаме, посещает пробудившуюся Марию Куренай в поисках ответов на свои вопросы. Она не даёт ему ничего, кроме загадочной подсказки, содержащей предположение о том, кто может быть настоящим врагом.Тем временем вампиры из Высшего Совета Вампиров прибывают в академию с целью покарать Зеро за совершённый им грех — убийство чистокровного. Однако Канаме вмешивается в решение совета — не только с целью спасти Зеро, но и по иной причине, о которой не догадывается никто из его окружения.