Год назад Ринтаро Окабэ удалось стабилизировать мировую линию, в которой ни один из его друзей не погибает. Однако многочисленные путешествия во времени, которые он тогда совершил, привели к возникновению множества побочных эффектов. Накопившись, они вызвали исчезновение Ринтаро из этого мира. И только его девушка Макисэ помнит о нём. Будучи талантливым физиком, она начинает искать способы вернуть любимого назад. Сюжет фильма разворачивается спустя год после событий сериала.Ринтаро Окабэ преследуют болезненные воспоминания. Зациклившись на созданных им временных линиях, постоянно думая о том, где он совершил ошибку и что сделал неправильно, юноша всё больше и больше теряет связь с реальностью.Тем временем Курису Макисэ возвращается в Японию после годового отсутствия. О том, что её любимый человек действительно существовал, ей подсказывает постоянно возникающее чувство дежавю. Этот феномен не даёт ей покоя, и она изо всех сил пытается найти способ, чтобы вернуть Окабэ.Сможет ли Макисэ достичь своей цели, и не приведёт ли всё это к ещё более запутанному парадоксу, мы узнаем в полнометражной версии «Врат Штейна».